在进行南京公司注册之前，有几个准备工作是必不可少的。首先是确定公司的名称，确保名称符合相关规定并且尚未被注册。其次是确定公司的经营范围和注册资本。最后，需要确定公司的法定代表人、董事和监事等公司管理人员。

准备好注册所需的材料后，需要到南京市工商行政管理局进行提交。提交的材料包括：

1）公司名称预核名申请表

2）法定代表人身份证明文件

3）公司章程

4）公司经营范围

5）注册资本证明

6）股东名册

7）公司地址证明等

提交材料后，需要等待相关部门对材料进行审批。审批的时间通常在10个工作日左右，也有可能更长。在此期间，如果有需要补充或修改材料的情况，需要及时配合。

在通过审批后，南京市工商行政管理局将发放营业执照。持营业执照可以正式开展经营活动。

在南京公司注册过程中，需要支付一定的费用。费用包括：

1）公司名称预核名费用：每个申请名称需要支付10元。

2）工商营业执照费用：根据注册资本的不同，费用也有所不同。一般情况下，注册资本在10万以下的公司需要支付500元，10万以上的公司需要支付1000元。

3）其他费用：如公司章程制作、代理费用等，根据具体情况而定。

在获得营业执照后，还需要进行其他申请，如税务登记、社保登记等。这些申请可能需要一定的时间和费用。

南京公司注册的流程和费用相对简洁明了。通过了解注册流程和费用，创业者可以更好地规划创业成本和时间。在注册过程中，建议寻求专业服务机构的帮助，以确保申请材料的准确性和高效性。