上海自贸区申请设立有限责任公司，应当向公司登记机关提交下列文件：
1.《公司登记（备案）申请书》
2. 公司章程
3. 股东、发起人的主体资格证明或自然人身份证明
4. 法定代表人、董事、监事和经理的任职文件
5. 住所使用证明
6. 批准文件或者许可证件（法律、行政法规和国务院决定规定设立公司必须报经批准的或公司申请登记的经营范围中有法律、行政法规和国务院决定规定必须在登记前报经批准的项目的提交）
7. 《企业名称自主申报使用信用承诺书》和《企业名称自主申报告知书》

上海自贸区注册公司流程分为四个步骤：
第一步，核准名称
时间一个工作日，在确定公司类型，名字，注册资本，股东以及出资比例后，可以去工商局现场或者线上提交核名申请，失败则需重新核名。
第二步，提交资料
时间三到五个工作日，核名通过后，确认地址信息，高管信息，经营范围，在线提交预申请。在线预审通过之后，按照预约时间去工商局递交资料。
第三步，领取执照
时间：预约当天
第二步通过后携带准予设立登记通知书，办理人身份证原件，到工商局领取营业执照正副本。
第四步，刻章等事项
时间：一到两个工作日，凭营业执照到公安局指定刻章点办理公司公章，财务章，合同章，法人代表章，发票章，至此一家公司算是注册完成。后续是其他税务登记方面了。
以上是创业萤火网小编为您整理的关于上海自贸区注册公司需要哪些手续的内容，希望对您有所帮助。