若要证明公司的实际控制人并非股东，可从以下几个方面入手。首先，搜集能体现实际控制人对公司重大决策产生影响的证据，像通过协议规定以及董事会席位的安排等途径来实际掌控公司的运营决策。其次，查找关于实际控制人对公司财务进行控制的情况的证据，比如在资金调拨和财务决策等方面的相关证据。再者，留意实际控制人对公司人事任免的掌控情况，涵盖关键岗位人员的任命与解聘等事宜。倘若能够提供这些方面的有力证据，例如相关协议、财务资料以及人事任免文件等，就能够证明其虽然不是股东，但实际上却控制着公司。需要注意的是，在证明过程中必须严谨且有充足的依据，以保证能得到法律的认可。