首先，明确有管辖权的法院至关重要。

通常来说，要么是被告的住所地法院，要么是合同履行地法院。

倘若在股权质押协议中存在约定管辖法院的条款，并且该约定是合法合规的，那就应当遵照其约定。

其次，起诉状的准备不可或缺。

起诉状需详细写明原被告的基本信息，清晰阐述诉讼请求，比如要求对方承担违约责任或者解除协议等。

同时，要详细陈述事实与理由，将股权质押担保协议纠纷的具体情况全面呈现出来。

接着，相关证据材料的准备也不能忽视，像股权质押担保协议的原件，以及与之相关的沟通记录，还有那些可能对股权质押状态产生影响的文件等。

把起诉状和证据材料一起提交给法院的立案庭，立案庭在对其进行审查后，若符合立案条件，便会予以立案。

之后，按照法院所安排的程序逐步进行审理，其中涵盖开庭、举证、质证、辩论等各个环节，最终由法院作出判决。