股东权确权纠纷的起诉程序大致如下：首先，明确有管辖权的法院至关重要，通常是公司所在地的人民法院拥有管辖权。

这就像是给诉讼找一个准确的“落脚地”。

其次，精心准备起诉状。

起诉状需清晰呈现原告（一般为股东）与被告（像公司或其他相关股东等）的基本信息，明确提出诉讼请求，比如请求确认股东资格以及股权份额等。

同时，要详细阐述事实和理由，并且附上详细的证据清单，让整个诉讼过程有依有据。

接着，把起诉状及证据材料递交给法院立案庭。

法院受理后，会依照法定程序把起诉状副本送达给被告，并通知被告进行答辩。

之后便进入庭审阶段，双方在此环节充分进行举证、质证，激烈地展开辩论，以争取对自己有利的结果。

最后，法院会根据查明的事实以及相关法律规定作出判决。

如果一方对判决不服，还可以在规定的期限内提起上诉，继续为自己的权益而努力。