代理注册公司是一项常见的服务，许多中介机构和财务公司提供此类服务。如果代理注册的公司随后涉及到虚开增值税专用发票等违法行为，代理机构及其相关责任人可能会面临法律责任。

刑事责任：根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条的规定，虚开增值税专用发票是一种犯罪行为。如果代理机构或其工作人员明知或应知客户注册公司的目的是为了虚开发票，仍然提供帮助，那么他们可能会被认定为共犯，受到刑事处罚。

行政处罚：根据《公司法》和《税收征收管理法》的相关规定，代理机构如果在代理注册过程中提供虚假材料或隐瞒重要事实，会被处以罚款，甚至吊销营业执照。

翟某案例：翟某为李广有、李明亮注册了两家公司，知道他们的目的是虚开增值税专用发票，但认为自己只是帮忙注册，不会有太大问题。最终，翟某因参与虚开增值税专用发票的犯罪行为被判处有期徒刑一年，并处罚金。

天津市涉税中介公司案例：一家涉税中介公司利用代理记账及代办变更登记的便利，虚开增值税专用发票，骗取留抵退税。该公司及相关责任人被查处，涉案人员被移交检察机关审查起诉。

为了避免卷入虚开发票等违法行为，代理注册公司时应注意以下几点：

尽职调查：对客户进行充分的背景调查，了解其注册公司的目的和业务模式，确保客户的真实性和合法性。

合规操作：严格按照法律法规的要求进行公司注册，避免提供虚假材料或隐瞒重要事实。

风险提示：在服务协议中明确约定双方的权利义务，提示客户不得利用注册公司进行违法活动。

持续监控：对已注册的公司进行持续监控，一旦发现异常情况，及时采取措施，避免进一步的法律风险。