若经营股东有职务侵占行为，可按以下办法处理。其一，公司需留存相关证据，像财务报表、交易记录等，用以证实职务侵占这一事实。接着，可让公司内部的监察部门或审计部门展开初步的调查核实工作。要是确实存在职务侵占行为，公司应依照公司章程以及相关法律法规，召开股东会或董事会，对该股东作出罢免或解除其职务等处分。与此同时，公司有权向公安机关报案，让公安机关立案侦查，以追究该股东的刑事责任。在刑事诉讼期间，公司还能提起附带民事诉讼，要求该股东归还被侵占的财物并赔偿损失。职务侵占罪的量刑是依据侵占数额等因素来确定的，侵占数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，同时并处罚金；侵占数额巨大的，处三年以上七年以下有期徒刑，并且处罚金。