首先，务必明确拥有管辖权的法院。

通常来说，要么是被告的住所地法院，要么是合同的履行地法院。

这是诉讼程序的关键起始点。

接着，精心准备起诉状。

需清晰写明原告与被告的基本信息，明确提出诉讼请求，像要求对方履行合同或是给予赔偿损失等。

同时，要详细阐述事实和理由，将股权转让合同纠纷的具体情形详细呈现出来。

然后，全力收集相关证据。

比如股权转让合同，它是核心依据；付款凭证，能证明交易的财务往来；还有股权变更的相关文件等，这些证据必须能够有力地支撑自己的诉讼请求。

之后，将起诉状和证据一并提交给法院。

法院受理后，会及时通知双方当事人。

随后便进入庭审阶段，在此过程中，双方要依次进行举证、质证以及辩论等环节。

最终，法院会作出判决。

倘若一方对判决不服，在规定的期限内还可以提起上诉，继续维护自己的权益。